次日开始，由投降的当地西夷和许尔显的人一起统计人口。
此时马尼拉有常住人口两万多，土着近一万，日本人近三千，华人数百，西班牙人七千多，另有少量欧洲其他国家的人。
所有军人除了在外的，都已经被驱使修建炮台。
余下的要么是普通百姓，要么是商人，官员，要么是军人家属。
在外的西夷也很快得到消息，打算反攻。
十一月二十五日，西夷和土着联军在后世甲万那端处受到惨败，被常建刚和蒙金联军重挫，死伤过千。
十二月十八日，西夷和土着联军又在后世比南奥南附近，被常建刚军再次大败。
两支在外人数最多的西军惨败后，想到家属都在马尼拉，终于决定投降。
西夷一投降，土着立马闻风而降，各族头人纷纷派人来献礼。
赵大山带领一万兵马，历经两个月，终于彻底打败了岛上的反抗力量。
当年西班牙人用了几百人，就征服了菲律宾。
西班牙对菲律宾的征服可以分成三个阶段。第一阶段是对菲律宾中部地区的征服，第二阶段是对北部地区的征服，第三阶段是对南部地区的征服。
第一阶段的征服为西班牙征服菲律宾打下决定性胜利作用。黎牙实比成功将产量丰富的菲律宾班乃岛纳入西班牙的势力范围。1569年，西班牙国王任命黎牙实比为菲律宾总督，归墨西哥副王节制。
1570年-1577年，西班牙将火力对准菲律宾北部地区。菲律宾北部有黄金和香料，藉由北部，西班牙还可以进行与中国的贸易。权衡之下，西班牙决定先征服北部，再征服南部。西班牙在这一阶段的行动也取得成功，它成功占领北部重要地区马尼拉，占领了整个吕宋岛。
不过，当西班牙想再征服南部时，便遇到比较大的阻力，南部土着强烈反抗，所以一直到二百多年后的19世纪，西班牙对南部地区的征服都没有实质性的成效。
在17世纪初期，西班牙对菲律宾地区的有效控制范围是以下这些地方：吕宋岛沿海地区（除吕宋岛东海岸和内地山区外）、比萨扬群岛的大部分（包括产品丰富的班乃岛等）。马尼拉成为西班牙人在菲律宾的活动中心。
西班牙征服这些地方后，在各地设立行省，由高官和总督控制这些省。在经济上，这些地方实行封建授地征赋制，同时实行重商主义，与全球其他地方的贸易持续了250年之久。在宗教上，西班牙人在中北