菜园子张青在混战中不幸被乱矢射中要害，死在了帮源洞，孙二娘寻得尸体后大哭一场。
厮杀结束，宋江令人烧毁方腊伪宫殿与一应禁物，随后引军来洞口屯驻，计点生擒人数，只有贼首方腊未曾获得。
随后传下将令，教军将沿山搜捉，告示乡民，但有人拿得方腊者，奏闻朝廷，高官任做。
半日后只见石秀抓手提一人前来复命，众人一看竟是方腊。
原来时迁看过攻略，鲁达已经在五台山坐化，为了顺利完成任务，这厮让石秀扮着樵夫绕路去帮源洞山上蹲守，结果守株待兔。
宋江知道内情后看时迁的眼神更阴翳了，心说你不但会排兵布阵，现在都能掐会算了，你不是要起飞吧？
战事已了，宋江遣戴宗去杭州张诏讨处复命，张叔夜传回军令，教把生擒到贼徒伪官等众，除留方腊另行解赴东京，其余从贼就睦州市曹斩首施行，并着众将在睦州休整，等待上命再定班师日程。
戴宗回来时一并带回了段景住与孟康，原来张横、孔明、侯健、朱贵、白胜五人因瘟疫已经前后病逝。
宋江思念亡过众将，潸然泪下，想起诸将劳苦，今日太平当以超度，便就睦州宫观净处，修设超度九幽拔罪好事，做三百六十分罗天大醮，追荐前亡后化列位偏正将佐。
在睦州休整期间，宋江写表章，备述辛劳困苦，申奏天子。部下正偏将佐，止剩得三十九员回军。那三十九人是：
宋江、卢俊义、吴用、关胜、林冲、柴进、李应、杨志、戴宗、朱仝、武松、李俊、阮小二、阮小五、阮小七、杨雄、石秀、燕青、朱武、樊瑞、宋清、童威、童猛、项充、李衮、凌振、杜兴、蔡福、蔡庆、朱富、裴宣、蒋敬、杨林、杜迁、李云、时迁、孙二娘、孟康、段景住。
在睦州休整了月余，也不见张诏讨回音，宋江又使戴宗去杭州。
在这月余中，豹子头林冲突发癔症，一会哭啼着呼喊娘子，一会又怒目圆睁叫着高俅之名，已生活不能自理，宋江着青面兽杨志每日照顾。
戴宗到杭州才发现张叔夜已经回京，刘世光让宋江等人不要着急，可引军去杭州等候消息。
宋江得到消息后陷入了沉思，吴用言道：“张诏讨该不会想独占功劳吧？”
宋江摇头说道：“以他的为人不该如此，再说方腊还在我们手中。”
“哥哥，人心隔肚皮啊。”
“我们先依刘都督的话，回杭州等信吧，