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《黑客帝国》中涉及到大量计算机、哲学、神学、无神论的专业知识，虽然徐存记得其中的所有台词，但现在与一九九八年毕竟差了将近十三年，而且为了让《黑客帝国》偏向于华人徐存又得对《黑客帝国》进行一些的改编，所以徐存从世界各地请来了一群《黑客帝国》所能涉及到方面的专家做《黑客帝国》的顾问。
徐存创作《黑客帝国》剧本的过程相当简单，他几乎就是将原来的《黑客帝国》三部曲的剧本照搬，然后让他请来的一大堆专家就他们所能涉及到的方面挑毛病——徐存甚至连《黑客帝国》中的角色名都没改。
其实——
不是徐存不想改《黑客帝国》中的角色名，而是他真改不了。
因为，《黑客帝国》中很多角色的名字都有深刻的含义。
例如：
尼奥（Neo）/托马斯·安德森（ThomasAnderson）：在希伯来语中，托马斯的意思是双生。这象征着尼奥平时的双重身份：一个是程序员托马斯·安德森，一个是黑客尼奥。而安德森在希伯来语中的含义是“人之子”，这正是耶稣的身份。组成Neo（尼奥）的这三个字母掉转顺序后就可以组成“one”，表示他就是那个拯救人类的救世主“TheOne”。而“基督”一词在希伯来语中的本意就是“被指定的那个人”——TheOne。
墨菲斯（Morpheus）：在希腊神话中，墨菲斯是梦神，拥有改变梦境的能力。在电影中，墨菲斯是把人们从梦境般的虚幻世界中唤醒的指路人。
崔尼蒂（Trinity）：Trinity的意思是“三位一体”，在基督教中，“三位一体”指的是圣父、圣子、圣灵。而在现代心理学的奠基之作《梦的解析》一书中，“三位一体”指代了女性意识，她能够进入神秘的领地和完美的境界。
先知（Oracle）：Oracle的希腊语本意是解惑、传递解释神的预言，可以是人、地方，也可以是物品。这些预言通常是模糊的，是现实的一种扭曲，所以能解释的人一定要很有智慧，但即使是他们也不一定能保证预言正确。先知的目的是用自己看到的模糊景象指导信徒，但不能帮他们做决定，决定本身完全取决于人们主观的意愿。
史密斯（Smith）：英文中的Smith意思就是铁匠，而他的车牌号是IS5416，这都暗含着宗教含义。在《圣经·以塞亚书》第五十四章十六节里说到：吹嘘炭火，打造合用的器