清太宗皇太极于六月十五率百官在沈阳祭太庙，尊奉其父野猪皮努尔哈赤为“承天广运圣德神功肇纪立极仁孝武皇帝”，庙号太祖；祖父到始祖都尊奉为王。十天后，皇太极大封其臣属。其诸兄弟子侄、诸外藩蒙古贝勒，及明降将孔有德、耿仲明、尚可喜都封为王。
之后皇太极的动作完全超出杨素的预料，刚刚称帝便即可出兵！令阿济格率十万大军攻打明朝，自己亲率五万军队攻打朝鲜，意图保住后方的安全，对抗在朝鲜驻守的明军。
锦衣卫刚刚从辽东送来皇太极命阿济格率军入关劫掠的消息，前线就传来战报，阿齐格就已经分三路奔向冀北，六月二十七日，阿济格兵分三路入喜峰口、独石口。
纵然杨素早已严令各方坚壁清野，将百姓回迁至城内，注意防守清兵入侵。但明朝早已腐烂到根子里，皇权不下乡是常态，但皇帝的命令地方官吏打折扣实施，却是让杨素也毫无办法。
明明已经下严旨，敢有不从者当即革职查办，事后更要交与锦衣卫追责问罪，但地府官吏不断找理由推诿拖拉，最后旨意被没有得到完全实施，不光面对清兵突然的入侵，毫无抵抗之力，更使百姓又遭一浩劫。
而独石口为外长城南北的交通要口，地势险要易守难攻，更是为长城要隘。为上谷之咽喉，京师之右臂！如此要塞居然被清兵半日而下，
巡关御史王肇坤拒战，兵败而死！黄得功奉杨素之命率军赶往独石口不曾想大军刚至半途，便得知独石口以破，不得已之下只能先命人飞马向杨素回报，之后率军退保昌平，以保卫京师重地！
京师戒严。杨素手上除黄得功之外无一大将可用，急令只能命方正化守龙泉关，急召卢象升、高起潜、秦良玉所部北上勤王。
几天后，又命王承恩领尚方宝剑巡视边关。五日，三路清兵齐齐会于京畿延庆，趁机攻打居庸关，居庸关天下雄关，短短一日便被清兵攻破，清兵在直隶省附近如入无人之境，天下震动！
崇祯九年七月十二日，清兵自天寿山后突现昌平城下，攻昌平城。明总兵巢丕昌作为内应降清，开昌平城门，大股清兵杀入昌平，幸好黄得功率部下拼死抵抗，将清兵逐出城内。否则京城左右再无险可守，京城便成为一座死城！
黄得功所部火器凶猛，清兵数度攻城不下，自身伤亡极大，阿济格见久攻不下，清兵入关主要还是为了劫掠明朝以弥补自身，不愿再与黄得功死磕，便命阿巴泰带兵继续围城，之后阿济格与扬古利继续带兵入京畿，又相继