实上，由于地壳的变化，各地火山活动频繁、地震不断，倭国沉入海底并不是什么天方夜谭。
后世有很多文艺作品在某种程度上还原了这段历史，比如由扶桑省著名导演骏宫其导演的灾难大片，倭国沉没，便比较客观公正的讲述了倭国沉没的全部过程。
位于亚欧板块和太平洋板块的消亡边界，本土大概有一百座活火山，是悬在倭民头上的达摩克利斯之剑，其中最具代表的就是已经沉寂了三百多年的富士山，它可是一座典型的活火山。
富士山是一座横跨静冈县和山梨县的活火山，海拔3775.63米，大概在数十万年前逐渐形成。
距今1.1万年前，古富士的山顶喷出了大量的玄武岩质熔岩，形成了现在富士山的主体：新富士。而从距今1.1万年前一直到距今3000，新富士一直在不断地喷出熔岩。
在有文字记载的文献中，我们可以找到富士山的多次喷发记录，比如：
公元800年-802年的延历喷发；
公元864年的贞观喷发；
公元1707年的宝永大喷发，这是富士山上一次的喷发，根据记载，当时的江户（也就是现在的东京）落下了4厘米厚的火山灰。
地震活动已经导致了倭国部分地区沉没，尽管倭国频发地震，且有一部分国土被海水淹没，但帝国地震科普学家赵隆平（1974——2055）认为，在三百年前的十七世纪，仅仅凭借自然地理变化，倭国全境或者大部分被淹没的概率非常小，几乎为零。
还有种可能是全球变暖导致地球极地地区的冰川不断融化，全球海平面升高，倭国海拔较低的地区将会被海水淹没，但并不会导致整个倭国沉没，一些地势较高的山地仍旧会露出水面。
考虑到十七世纪大齐工业葛敏尚未完成，全球变暖更是无稽之谈，所以这个论断毫无意义。
当然，地质运动导致太平洋板块俯冲到欧亚板块之下，也可能会将倭国冲入到马里亚纳大海沟之中，甚至会将其沉没到地幔层中。
从理论上来看，存在着这种可能，但是整个过程非常缓慢，至少需要数百万年甚至上千万年。
总之，三百多年前的某个夜晚，倭国本州（包括四国岛一部分），忽然在一夜之间沉入了海底，德川家光和他的千万子民，全部葬身鱼腹，成为水族一员。
现在学界普遍的看法是，那是太上皇的神迹。
当然，也有神秘组织（帝国反叛军）信誓旦旦