功拿下了东寺。随林寺和泷尾神社。然而，由于长福寺的得而复失，目前位于东寺的今川军和随林寺的武田军，却被和鸭川东岸的南军主力分割开来了。
于是，天文十四年（1546）年4月9日起，南军为了打通两部之间的联系，开始集中兵力猛攻作为战略枢纽的长福寺。北军自然也不会轻易放弃这个抓手，将丢失了阵地的山名军和河野军也调到了西岸，由他们和毛利军、大内军、大友军、赤松军、浦上军一起，轮流进入长福寺戍守，抵御南军的攻势。
毛利家是大内家的从属，大友家和河野家是盟友，大内家和大友家也是同盟，而他们和山名军之间又有着共同的敌人尼子家——这几家大名在地缘利益上颇为一致，没有什么矛盾，也不会刻意地出卖友军，配合融洽。反观南军各部，从西边攻来的今川家与武田就爱和从东边攻来的斋藤家和北条家之间却是不对付。此消彼长之下，长福寺也是久攻不下。
而在鸭川东岸，朝仓军、浅井军、织田军、六角军、若狭武田军则在联合攻击三十三间堂、智积院一线的北军。这几家大名之间的利益纠葛同样错综复杂，难以全力以赴。奋战多日，才终于拿下了智积院。可随着游佐军和波多野军退到新日吉神宫，与作为二线预备队的尼子军会和后，东岸的南军就再也难以突破了。养精蓄锐的尼子军以雄厚的兵力发动多轮反击，险些将智积院又夺了回去。
就这样一直拉扯到了天文十四年（1546）年5月1日，战线还是毫无变化。细川晴元终于坐不住了，下令全线停止进攻，东寺和随林寺的今川义元和武田晴信也带着侍从从小路绕回了南军设在光明院一代的新本阵，重新召开评定会议，商讨对策。
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「这样拖延下去，什么时候才是个头？」久攻不下的细川晴元不由得有些烦躁起来，「皇宫和二条城一直落在逆贼手中，也不是办法，诸位爱卿可有良策？」
「一直这样纠结于一寺一社的得失是没有用的，千辛万苦打下一个地方，说不定转瞬又会被抢回去。而且打下一个地方，就要耗上十几天，一地一地磨蹭到二条城去，不得耗个一年？时间拖得越久，北军的防御工事修的越完善，我们越难打。」织田信长当仁不让地率先拍案而起。
「那依织田三郎的意思，是要想办法把局面搅浑？」一段时间的相处以来，朝仓宗滴似乎对织田信长愈发欣赏，「还是像我们在4月初的那一战那样，在多个寺社间快速迂回包抄，打穿北军的防线，从
而想办法一口气夺