第一部《殷家血案》
小法医杨秋池遇上雪崩，带着一堆器械穿越时空回到大明，变身小仵作，重操“旧业”。
殷家少奶奶白氏和她的妹妹被人残忍地杀死在房中。现场的证据指向了管家胡三，经过调查却发现胡三并非杀害白氏姐妹的真正凶手。真凶到底是谁？
白氏死而复生，但是她拒不说出凶手。她“复活”的当天晚上，居住的小楼无故起火，难道是凶手想杀人灭口？
殷家的血案还没有查明，却意外查到了一封不知寄给谁的谋反信。此事惊动了锦衣卫，他们插手能查个水落石出？
葫芦还没按下瓢又起，这两个案子的千头万绪还没理出个所以然，应天府的百千总去要来为女儿讨个公道……
且看小小仵作如何利用现代行刑侦手段，抽丝剥茧、把这纷繁复杂解得个顺理成章。
第二部《白骨谜案》
秀才龙子胥杀妻埋骨，定于秋后问斩，他一直苦苦喊冤。杨秋池心存疑虑，化验了凶器上的血迹，发现并非人血。
杨秋池复原了尸体的头骨，辨认出死者并不是龙子胥的妻子，而是醉莺楼头牌姑娘金可莹。（ ）龙子胥之妻身在何处？这金可莹又是何人所杀？
案情有了眉目，杨秋池艳福又至，大贾之女郝倩，有沉鱼之貌，咏絮之才，愿嫁杨秋池为妾。这是馅饼还是陷阱？
杨秋池顺藤摸瓜一路追踪，凶手却总是先他一步杀人灭口……
第三部《纵火迷云》
杨老太爷的小妾曾发花痴病，羞愧之下投缳自缢，杨老太爷担心她所生的孩子并不是自己亲生，便求杨秋池做个亲子鉴定。
杨秋池细查之下发现那小妾是被人谋杀，儒雅的杨清水、爱争宠的二姨娘、善妒的杨家少奶奶……杨老太爷一干人似乎都有嫌疑……
杨秋池前往湖广清溪县赴任，途径武昌，沿路饥民遍野、遗骨千里，两次赈灾的粮食都无故被烧，迷离百变的案情威胁着天下苍生。杨秋池抽丝剥茧，对手手段奸诈，势力不凡，死亡的阴影正一步步笼罩过来……
第四部《苗疆惨案》
杨秋池前往湖广镇远州赴任，新官上任，就接到了烫手的山芋。苗寨寨主云天擎的儿子云愣，纵火烧死了县衙王典史及其小妾，当场被抓获，判斩立决。监斩当日，苗众聚集企图劫持法场，云愣大呼“冤枉”。乖乖，又是一起错案？
杨秋池一路追查王典史小妾行踪，发现雷雨过后的山路旁，有一具