第二步是：码头和营房建好后，立即组建三万以上的陆军和二万以上的水军，一边训练，一边开荒。淮西和和北方分会所属各基地，开始招收流民，，前三年可以先招收三至五万流民去开荒种地，
同时建立健全组织机构。成立万通商会山东分会，方腊任山东分会会长兼粱山兵马总管，朱武、杨志、方天杰、史文恭、阮小二任兵马副总，负责马步兵军训练，朱武参赞军务。
阮小二任水军统领、阮小七任副统领。柴进、武松、吴用、胡金山、蒋敬任分会副会长。
柴进主管卧虎山庄及对金、辽的贸易和战马的购买。武松、吴用、胡金山负责分会商业事务，蒋敬负责财务帐目。
燕青、戴宗、萧让、李逵、皇甫详等留在沧州作柴进的助手。燕青带两百特训营士兵留在沧州听从柴进调遣。皇甫端到梁山任兽医营统领负责粱山的马匹和猪、牛疾病的治疗与防控，皇甫祥任副统领，负责沧州的战马及猪牛羊疾病的治疗与防控。
白胜到特训营接受特训，准备执行秘密任务。
方腊走后，王寅负责江南行政事务，娄敏中负责特区事务。鲁达、方天俊从海外调到开封府作听用。赵重阳在沧州这里把所有消息发布完后，就开始让在沧州这里的各人立即展开行动。
二月中旬，赵重阳在仇琼虎率领的特训营护卫下回到开封府。第二日就送信给蔡京，二月十六日开封府尹张叔夜接吏部通知，到吏部任右侍郎，官升从三品。
所缺府尹一职由同知赵重阳暂代，从此开封府的最高行政大权落入赵重阳手中。
代理开封府的府尹后，赵重阳将自己私养的捕快抽一部分在公职人员中，由甘雨明和林冲共同负责。而时迁、仇琼虎继续负责侦揖工作，同时从各地抽调身手好，人年轻，身体素质好的自卫队员到开封，将特训营的人数提升到两千。教练由丘道乙、时迁、仇琼虎三人轮流担任，林冲、赵重阳、庞秋霞、琼英、方百花有时也去帮着训练。
清明节快到了，第一代杂交水稻准备开始试种，从南京府赶过来的几十名男女家奴，在方百花和庞秋霞的率领下开始按赵重阳传援的方法种植杂交水稻，第一年，计划种植六十亩。同时，将去年培育杂交水稻种子的实验基地扩大三倍，继续培育新的杂交水稻种子……
成了代理府尹，赵重阳在京城的名声更响，也成了各个大佬和各方势力拉拢的对象。赵重再次得到提抜重用，大家都知道是再次走了蔡京的门路。但其它各方势力并不认为赵重