如征银招募来补足军队数量等改革的进行，张居正也一直尽力在办。
其实也正是因为张居正不比徐阶、李春芳这些甘草宰相，他能做事，所以高拱明知道两人已经开始有些龃龉，却仍然一直维持盟友状态。
高拱自己在这些方面当然也有自己的考虑，他在隆庆三年底复出，隆庆四年初便上《议处本病及边方督抚兵备之臣以裨安攘大计疏》，并接连上《推补兵部右侍郎并分布事宜疏》、《虏情紧急议处当事大臣疏》、《议处本兵司属以仰裨边务疏》、《议处边方有司以固疆圉疏》、《议处各省兵备疏》等书，并得到隆庆帝一一批复。
高拱迅速展开了军事体制的改革和军备整顿，包括兵部人员设置调整、军备人才储备制度、体恤边官的休假和内迁制度、军备官员特迁制度、久任之法等一系列制度的建立或申严，裁汰庸弱将领、选贤任能，等等。这些举措使明朝军备状况大大改善。
到了这个时候，大明“内功”略见成效，就必须找个机会来展示一下，以震慑俺答。
但问题是：直接从宣大出兵与俺答对刚，还是从蓟辽着手，打击土蛮来震慑俺答呢？