游击下中军一，千总二，把总二。守备下中军一，把总一。”
此外防守官又以卫治为中心，四向分守，这里暂不多说。
卫所官军分番校阅，置屯遣戍，主要以护守城池、防御胡虏、备遏盗贼为任务。
西宁卫与高务实曾任的辽东地区有些类似，都是军民兼治，下辖西宁、碾伯、镇海、北川、南川、古鄯六千户所，同时兼领“塞外四卫”——即洪武八年(1375)后，相继在柴达木盆地西部所设安定、阿端、曲先、罕东四卫均由其节制。以“西番之势益多，其力益弱，西陲之患亦寡”的施政策略，维护明廷于此的统治秩序。
西宁卫作为兼司地方行政的机构，其下有编户四里，即巴州、红崖、老鸦和三川，由卫经历司进行管理，对周围藏族各部(明朝统称“西宁十三族”)也行使监督权，各部落僧俗头目“每岁遇万寿圣节、正旦、冬至俱赴卫行庆贺礼，又每月赴卫听受约束”。
卫指挥一级的官员中有专司“抚夷”之职者。弘治初置西宁兵备道后，“抚治番夷”也是副使的重要职责。
明朝西宁卫城大致在现今的西宁市中心(现存北城墙、东城墙、南城墙部分残垣)。对于明朝西宁卫治西宁城池的修筑，有明一代，洪武、嘉靖乃至万历年间都曾动土兴工。
洪武、嘉靖年间的修建没必要多说，万历年间的修建却不得不提一下。
万历三年(1575)三边总督、兵部尚书石茂华、巡抚都御史侯东莱以西宁城“土垣渐圮，历亦不时窃忧，驯至可忧”为由而加修。
此次工程由西宁卫兵备副使平康裕和董汝汉、分守参将萧文奎、凉庄游击吴钺督率军民庀材修筑。这次修筑可谓“砖包城”，其规模及牢固程度空前，在西宁卫参议张问仁所撰《重修西宁卫城记》碑文中记载了这次修成的城池的建制大小。
这个新的西宁城，在换算后的周长为5704米、高15.3米、底宽16.65米、顶宽10米，较之明洪武、嘉靖年间的规模都要大。
这次工程“图形势、议工力、料物用、分职报、约程限、申法令”，兴师动众，颇费财力、物力和人力。城池修成后楼橹、铺舍、杆具，无一不精，炳如翼如，且固且丽。
就是这样一个新修不过十年出头的西宁新城，居然极其突然的被青海土默特部攻破了。
本来这是朝廷军务，跟曹淦这个京华商社的大掌柜没什么关系，但他却在密函中告诉高务实，青海土默特的著力兔、火落赤兄弟很可能