但两个原因似都流于表面，尚未触及根本。
吕布要杀掉董卓的根本原因，就在于董吕关系的脆弱性上。
进而可延伸为并凉武人之间的矛盾，在这种矛盾中，并州军处于被动的态势中，随时都可能被凉州军蚕食，而失去了武装，吕布也就失去了立身之本，为谋求自身及其集团的发展空间，吕布也会反戈相击。
这时王允的介入，想必就是看到了董吕之间这层微妙的关系，加之在一次次密谋诛杀董卓的活动流产，王允引外兵勤王的计划又遭夭折的情况下，出于对武装的渴求，才将视线转向握有兵马的吕布身上，下出了联络吕布的这一着险棋。
（这里的引外兵勤王应该指的是向刘虞求助，《三国志》记载，汉献帝曾经向远在刘虞求援，刘虞也打算率兵前进，而且还派遣自己的儿子刘子和，若是一场意外的话，那么史书就在也没有“挟天子以令诸侯”，而是“助天子已令诸侯”！而这场意外，就是袁绍，袁术，公孙瓒故意阻拦，公孙越为什么会率骑兵南下，就是为了抓刘子和。）
而吕布能倒向士大夫阵营，除去上面讲到的董吕关系的脆弱性外，还有着其他方面的原因。
一是王允与其有同乡之谊（按：王允系太原郡祁人，吕布系五原郡九原人，二人同为并州人士），无形当中拉近了王吕之间的距离；
二是士大夫政府的合法性仍旧对一介武夫有着约束力；
三是董卓进驻长安前，把凉州军的主力布防于长安以东的陕县一线，用来阻挡关东士大夫武装可能的西进。
这就为吕布敢于同董卓兵戎相见提供了可能。
于是，王吕的结合，终于演成了下面的一幕。
初平三年夏四月辛巳，董卓在重兵护卫之下，前往未央殿赴朝会。
当行至掖门的时候，宫门卫士突然手持长戟向他刺来，猝不及防的董卓慌忙向吕布求援，未成想吕布却从怀中摸出一纸诏书，向他宣布了死刑。
董卓死了，董卓死了。消息传开，长安百姓顿时喜笑颜开，载歌载舞走上街头，喝酒吃肉，把这一天当作了节日。
曹操听后，忙问道：“那王司徒，对剩余的西凉军如何处置呢？或者说对董卓的残党怎么处理？”
“面对董卓死后留下的大量财富，吕布提出“以卓财物班赐公卿、将校”，拉拢人心，但是，王司徒不同意，他认为董卓贪污国家资产，鱼肉百姓，所以他把所有的钱财全部充公！”
曹操听后沉默不语。