十二军制度没能按计划实施，正当李世民他们想尽办法的时候，机会来了。
李渊为刘武周的入侵而担心，于是派右仆射裴寂前去出战，任命裴寂为晋州道行军总管，讨伐刘武周。刘武周，祖籍河间景城，迁居马邑，在隋末群雄竞起的纷乱形势中，依附突厥，图谋帝业，起兵进而率军向南进犯，攻陷河东大部地区，威逼关中。
裴寂经常不在长安，所以李世民趁他不在，看准时机，向对李渊请求实施十二军制度，说的话就没有太多的人反对了。
李世民向李渊说明了十二军制度的好处，以及对以后安定天下必然会起着重要的作用，并建议马上整顿关中的军队。
李渊还是思虑再三，最终同意了李世民的意见，但他规定十二军要与十二卫并存。
李世民知道这是最好的结果了，谢过了李渊。
武德二年，七月，大唐在李世民的组织及整顿下，关中军队设置好了十二军，关内各府分别隶属于十二军，均取天星的名称，由车骑府统领，每军的将军、副将各一人，选择素有威望者充任，督察农耕与战备。
从此大唐全民皆兵，兵强马壮，军队战斗力超强地提升。
关中的形势一片大好，而关外形势却是想不到的严峻，不容乐观！
王世充攻陷义州之后，又侵犯西济州；刘武周攻陷平遥；窦建德攻陷沧州；宋金刚侵犯浩州；窦建德攻陷相州，杀死唐相州刺史吕珉；梁师都与突厥合兵以数千骑兵侵犯延州……
这些致命的信息，在这几个月里面不停地报告给唐高祖李渊。
高祖觉得头就快要爆炸了，还有一个关于民部尚书鲁公刘文静要谋反的奏章，更让他觉得这天下好像都要谋反，他怀疑身边的每个人。刘文静，字肇仁，京兆武功人，祖籍彭城，唐朝开国功臣，原为晋阳令，后联络裴寂与李世民，协助李渊起兵反隋，并奉命出使突厥，后随军南下，击败桑显和、俘获屈突通，唐朝建立后，刘文静出任纳言，成为宰相。他后随李世民平定西秦薛仁杲，历任尚书、陕东道行台左仆射、鲁国公。
这个奏章是这样来的。刘文静与弟弟通直散骑常侍刘文起一起喝酒，喝酒多了不禁发怨气，拔刀砍柱子，说道：“应当砍了裴寂的脑袋!”他家里多次出现怪异的现象，刘文起召来巫师在星光下披散着头发、口中衔着刀来避邪。刘文静有位侍妾不受宠，那些她都看到了，于是让她哥哥上告刘文静要谋反。
真是喝酒惹来的祸啊，而刘文静那句喝醉