孙承宗从前屯回到山海关，继续查点原来广宁卫将佐的编制。他发现一个将军至今下落不明。他的名字叫祖大寿。
孙承宗又把广宁道佥事万有孚找到了自己的跟前：“万佥事，你知道祖大寿这个人吗？”
万有孚点头说道：“卑职知道。”
“这个人跑哪里去了？”孙承宗疑惑地瞅着万有孚。
万有孚微然一笑说道：“他现在就在觉华岛。”
孙承宗即刻派人去觉华岛召回祖大寿。这位漂流海外的祖大寿怀揣着极度不安的心情来见孙承宗。
孙承宗见到祖大寿很是客气，询问了一下祖大寿这些日子流亡海外的经历，并极力安慰他：“将军受苦了。平阳桥之败，本帅早已获悉那乃是奸贼孙得功所致，与将军无关，本帅一定会为你平冤昭雪。”
祖大寿闻言失声痛哭，发誓效忠朝廷，效忠孙承宗。
孙承宗慨叹了一番，随后说道：“祖将军，你在觉华岛的军兵还有多少啊？”
祖大寿掐指算了算：“启禀大帅，大概齐二百多人吧！”
孙承宗笑了：“二百人焉能守住觉华岛。”
孙承宗命人找来游击将军金冠，吩咐道：“金冠将军，本帅命你率领三千人马驻防觉华岛，打造战船，囤积粮草。祖大寿将军作为你的副将，共同守卫觉华岛。不得违误！”
金冠与祖大寿一同领命，点兵前往觉华岛驻防。
孙承宗收编祖大寿的消息一传开，引来了另外一个漂流海外将军——皮岛总兵，毛文龙。
广宁战败之后，毛文龙吓得跑到了皮岛（又叫东江）。所幸当时的努尔哈赤没有战船，而金兵多不习水性，所以毛文龙在皮岛上过得也算逍遥快活。
孙承宗出任辽东督师之后，毛文龙立刻得到了消息。他火速搭上了这位新领导，并在孙承宗的面前痛苦流泪：“卑职终于找到组织了。”
孙承宗久闻毛文龙的大名，两人攀谈了一番过后，孙承宗觉得毛文龙确有一定的才干。孙承宗一口气赏了毛文龙一万两白银，让他巩固皮岛的防线，并随时接应自己的军事行动。
毛文龙立刻跪倒在地，在孙承宗的面前赌誓发愿：“只要大帅一句话，毛某万死不辞。”
孙承宗送走了毛文龙，又派声名赫赫的老将沈有容驻守广鹿岛。
没多久，江应诏由于军饷的问题被朝廷言官弹劾。孙承宗上奏天启皇帝，由马世龙代替江应诏出任山海关总兵一职，领兵一万五千