在近江的村落里，没落的武士后裔橘右京，却有着高超的剑术“神梦想一刀流”，是远近闻名的居合斩名家。他温柔文雅的容貌，俘获了许多少女的芳心。她们所不知道的是，右京因为肺病的折磨，陷入深深的空虚与孤独感，认为自己会独自死去。
这个想法在某一天有了改变。因为躲避京都的瘟疫而来到乡下的领主一家的女儿，恬淡文静的小田桐圭出现在右京的面前。柔和的谈吐和凛然的气质，与众不同。只是由于身份的差距，少有相见的机会。田间的道上，两人偶然邂逅。圭无论如何都想为整日病卧的母亲摘下峭壁边绽放的美丽花朵。右京替她摘下了花，圭文雅的向他道谢：“右京先生，也喜欢花吗？无意中看到盛开的花朵，打动了我。”如同在平静的水里投下石子，那一刹那，右京的心中涌起了继续生存的乐趣，他可以为自己所爱的少女献上世间美好的花朵。
圭因为母亲的病陷入惆怅。蔓延的瘟疫令人们惶恐不安。这时候传来消息，遥远的京都盛开了究极的花朵。那是能够治愈百病，延长生命的灵药。
望着忧心忡忡的恋人，右京决定前往京都。那里似乎已经变得凶险无比，不仅有瘟疫流传，还有狂热的血族作乱。然而，若是只有究极之花才能带回恋人的笑容……右京带上爱刀“自作·无铭”，去了京都。
但右京不知道，京都早已不是原来的京都，所谓的能够治愈百病，延长生命的灵药都是假的，只是血祖徐勇放出的幌子，招揽或者清除人族强者的诱饵。
在这京都，牛头天王将疫种撒在这里，疫种
在京都的上空交叉穿行；它们还好像是无形的浮云，笼罩着京都，渐渐酿成一场是非的血雨。这雨也不是什么倾盆的雨，而是那黄梅天里的雨，虽然不暴烈，却是连空气都湿透的，使得整京都弥漫着一股血腥味。
月光在花窗帘上的影，总是温存美丽的。逢到无云的夜，那月光会将屋里映得通明。这通明不是白日里那种无遮无拦的通明，而是蒙了一层纱的，婆婆娑娑的通明，就像恬淡文静的小田桐圭的笑容一样。而在这儿，右京只看一轮血色红月下，血族肆意吸食人类。
右京悲哀的发现这个东京变成了一个吃人的炼狱，京都的人们都瘦削丕堪，黄中带黑，而且没有什么悲哀的神色，仿佛是木刻似的；只有那眼珠间或一轮，还可以表示他们是一个活物。
如细雪般的剑光持续收割了几个血族的头颅后，右京的肺病犯了，正当右京要被愤怒的血族生撕了的时候，宫本武藏救了