修，重修的话每门课要付钱五百个铜钱，约合半两银子。每半年必修课四门，分为经学、史学、文学、法学四科，逐步加深。选修课四门，学生可以根据老师开设的课程自选。两年所有课程考核合格后，还得做一篇论文通过，方能毕业被授予学士。学校中设有研究院，学士毕业有志于继续研究学问，可以到研究院申请继续攻读，由导师选择录取，一年可以毕业被授予博士，不过看难度一般一年很难毕业。学生每五天休息一天，其他时间根据课程安排上课，有班级专用教室和流动教室。班级专用教室用于班级集中活动或者学生自修，流动教室用来上各种课程。
学校鼓励学术交流，经常举办各种讲座，邀请学校导师或者各地名师来校讲座。学校鼓励学生互相研讨砥砺，允许学生组建各种社团开展活动。也鼓励学生结伴游历，提高见识。学校也给贫困学生提高勤工俭学机会，在学校提供一些如打扫卫生、图书管理等岗位。
上课一般早上八点开始，下午四点结束，中间午休一个时辰。上课也可以请假，只要自己能保证课程考核通过即可。班导师负责日常管理，日常请假等须向班导师报备。学校有藏书楼可以借阅书籍，只要登记好保存好即可。
李云对书院的各种制度很满意，给学生充分的自由，也不强制住在学校，很适合自己的情况。“也许通过两年的学习，自己就可以掌握各种社会的知识，对大道有更深层次的认识，达到结丹境界了吧？”李云躺在床上默默想道。