此时明朝的战略核心是落日行动、蒸汽革命和军事改革，面对黎氏这个跳梁小丑，朱由校选择了暂时的沉默，既不招抚，也不反击。这种绥靖的态度让黎氏更加肆无忌惮，利用商周祚、袁崇焕等将领变换驻地的机会，从陆上再次入侵奉化府和建昌府，兵锋直指安州的云南省府和沐王府。
南越中部的阮氏见明朝似乎并不关心滇南一带，暗中收买葡萄牙人帮助他们建造战船和火器并大肆招揽散落在南海诸岛的倭寇、海贼。在李魁奇、何斌、郭怀一等人的带领下不断抢劫南海中的各国商船，试图控制马六甲海峡垄断明朝的贸易，风波未平的大明海疆上再次阴云密布，炮火纷飞。
航线受阻的消息很快传至紫禁城，除了几个不开窍的言官将矛头指向军区改革外，大部分人都选择了沉默。看完这群书呆子的表演，朱由校的内心早已有一万只草泥马在奔腾。他心知不能放任南越的黎氏和阮氏这么折腾下去，外敌虽然可恶，但是内贼更让人可恨。
胡宗宪的《筹海图编》第四卷有记录说：“今之海寇，动以数万皆托言倭奴，而其实大略是中国海盗居其大半”，意思是说当年倭寇的祸乱其实有多半是内地汉人假扮的。对于造成这种现象的原因，朱由校不愿意去过多的思考。
他可以招抚郑芝龙、颜思齐、杨天生、李旦等海盗，因为这些人主要的目的是从内地走私商品进行国际贸易，变相的促进了沿海手工业的发展，而且他们的主要竞争对手是荷兰、葡萄牙等红毛夷，从民族大义上来讲他们是有功的。
与之不同的是，李魁奇、刘香、何斌、郭怀一、杨六、杨七等人完全是为了一己之私，或投靠西洋人，或依附南越小国，不断引狼入室，将屠刀挥向自己的同胞，这种人就该生时被活剐，死后打入十八层地狱。
等言官们喷完小皇帝提出的战区改革，他们见坐在龙椅上的那位面无表情，识趣的退到后面躲避即将到来的暴风雨。朱由校环伺一圈，并不急于表态，顾左右而言他的问道：
“朕前几日翻阅宫廷档案，认真拜读了胡宗宪的《筹海图编》，发现一段世宗年间的趣事。据说几十名倭寇从浙江登陆后不断烧杀抢掠，最远处跑到安徽一带，后又转至南京城外，沿途十几万军队竟然如临大敌，唯恐避之不及，这是什么情况？”
倭寇的问题由来已久，到嘉靖年间最为猖獗，当时东南沿海几乎是生灵涂炭，许多人都自发的加入到抗倭的战斗当中。后来朱由校准备跨海实施落日行动，还未开始动员便已全民皆兵，尤其是浙