级单位太过庞大，应付小规模战斗需要更加灵活的力量，于是刘璋设立了独立旅这一编制，第一至第五旅为精英部队改编，战力强大，兵力相对灵活，其余番号的独立旅兵力则比较固定，每旅六千五百人。
第二野战军团（也称南阳军团），驻南阳郡，负责洛阳、兖州和豫州一线作战，军团长徐晃，黄忠和关羽任副军团长，参谋长法正，副参谋长蒯良（荆州刺史一职由其弟蒯越升任）、张松，辖步军第三师、第六师、第十师，骑兵第二师，步军独立师（唯一的独立师级单位，原英武军扩编，英武军的称号保留，全师皆为参加过战斗的老兵，兵力达到一万人），步兵独立第四旅（东州军一部，七千人）、步兵独立第七旅，一个一万人的野战军团支属师，总兵力八万五千人。
第三野战军团（也称豫章军团、荆东军团），驻江夏、豫章等，主要负责扬州方向作战，军团长鲁肃、副军团长甘宁、张辽，参谋长王累，副参谋长司马郎、刘晔，辖步军第二师、第八师、第十一师，水军第一舰队、第二舰队、第三舰队（分驻豫章、江夏、江陵，第一舰队规模最大，三万人，第二舰队两万，第三舰队主要负责荆州各地转运物资，规模最小，仅有一万人士兵，但有大量民船和民夫相助），水军独立第一旅（锦帆军，五千人编制），水军陆战师一个（一万五千人，随战舰行动，专职负责登陆作战），骑兵独立第二旅（三千骑兵），另有军团直属旅两个（分别负责水、陆两路侦察、医疗、后勤、警戒，两个旅共有一万四千人），计有水陆大军十四万人。
第四野战军团（也称机动军团、成都军团）平时负责益州腹地安全，战时作为援军支援任意方向战斗，军团长严颜、副军团长张飞、于禁，参谋长单福，副参谋长张任、阎圃，辖步军第七师、第十二师、第十三师、第十四师、第十五师（大师，两万人编制，唯一一个全部由蛮人组成的部队，负责山地作战），成都师（大师，三万人编制，后来被称为首都师，主要负责成都防务），虎卫师（刘璋亲卫师，由一万七千步兵、三千骑兵组成），骑兵第三师，独立骑兵第一旅（按刘璋的设想，应该建设成为一支和历史上董卓的飞熊军、曹操虎豹骑那样的精兵，不过组建时日尚短，战力有待检验，全旅五千骑），水军第四舰队（两万人编制，驻江州），一个一万五千人的野战军团直属师，总兵力达到了空前的十七万五千人。
各师旅长：步兵第一师师长李严，第二师师长吴懿、第三师师长黄忠（兼）、第四师师长袭都、第五师师长侯成、第六师师长关