一个时辰后，刘璋离开祭台前往太庙，祭祀大汉历代先帝。
此时大汉的太庙本在洛阳，董卓迁都后将长安城中原西汉太庙遗址略作了修葺，供奉着自汉高祖刘邦至汉灵帝共二十七位先皇的灵位。刘璋攻下长安后，又命人大规模重建，并将被董卓害死的汉少帝刘辩的灵位也供奉在里面。
刘璋只是一位诸侯王，按礼制是没有资格祭祀社稷和太庙的，可是刘璋认为自己身为大汉皇室，奉旨在长安建立王国，而长安又修建有社稷、太庙，于情于理，都应该祭祀大汉社稷和历代先帝。虽然荀彧感觉有些欠妥，可是一想刘璋之言也并非全无道理，就算不能祭祀历代先帝，但是刘璋用刘氏子孙的名义祭祀各位先祖又有何不可呢？
告天、祭地、祀鬼，忙碌了大半日，仪式总算结束了。刘璋率领众人回到皇宫，正式登上蜀王宝座，接受百官朝拜。
而后，刘璋又册封蔡琰为王后、长子刘循为蜀国世子，百官再次朝拜王后、世子。
礼成后，蔡琰携长子回了寝宫，刘璋则开始新的人事任命。
刘璋没有按照汉律归定任命相国、都尉等王国、侯国官职，而是对蜀王国官制进行大刀阔斧的改革，他仿后世封建王朝六部制，辅以内阁、都察院、大理寺、太学（蜀学）等部门；接着又改革爵制，取消汉代侯、卿、夫等爵位，恢复先秦时期公、侯、伯、子、男五爵制，每级又分一、二、三等，共五级十五等，受爵者不享受食邑、封地，但是可以按月领取相应爵位的特殊俸禄，爵位可以传子，但是每传一代则降一级，也就是说如果父亲是一等公爵，那么儿子只能世袭一等侯，如果父亲是一等男爵，那么儿子则无法世袭爵位。
刘璋任命荀彧为内阁总理，兼任长安令，辅佐刘璋治理蜀国，乃百官之首；其他主要部门官员：兵部尚书徐晃，吏部尚书荀攸，户部尚书满宠，工部尚书马钧，刑部尚书程昱，礼部尚书陈群，都察院左都御史毛玠、右都御史司马郎，大理寺卿伊籍，太学院院正蔡邕……郭嘉、戏志才、贾诩、三位兄长等皆授都察御史一职，并成为内阁成员。
至于爵位，为了保持麾下文武的斗志，刘璋采取高职低配的办法，荀彧作为百官之首，为封一等伯爵；而后是徐晃、满宠、荀攸、严颜、魏延、鲁肃、蔡邕被封为二等伯爵；四大野战军团各副军团长、正副参谋长、荆州刺史蒯越、益州刺史诸葛谨、凉州刺史张既（刘璋迁治长安后将他从汉中太守一职升任）、益州别驾王累、蜀学益州学院院长郑玄、蜀学荆州学院院长庞