官，武将只有拼命的份。在朱厚炜看来，文官们积极推行的“以文御武”管理模式，就是个笑话，弘治十五年，朱厚炜提出了”专业的事情交给专业的人做”的口号，不允许外行指挥内行的情况再次发生，他首先从自己的封地开始实施这一套理念。
由于朱厚炜惊人的战绩，包括正德皇帝当太子时，平定了北方草原，又开辟了新疆，恢复了汉唐的华夏领地。赫赫战功下，如今“以文御武”这种话，再没有哪个文官敢公开提出来，否则只有一个下场，那就是去边关当兵，正德皇帝公开宣布，谁觉得“以文御武”好，他就请谁边关最偏僻的哨所去当哨长，从那里开始御起吧。
军事改革完成后，可以说皇权得到了空前的加强，尤其是军权，除了军机处，任何部门的文官不得参与。这些年朝局的变化，让期望大明皇帝垂拱而治的杨一清内心很是不安，他真的很恐惧，皇权如此大，正德皇帝皇帝会不会变成那个一扫六合的秦始皇，一言不合，就会再来一次”焚书坑儒”。坐在那里，杨一清想想都不寒而栗。
自从弘治十五年开始的军队改革后，十几年来由北至南逐步推行下去，一直到正德四年才算是大功告成。大明所有的军队都重新经过了整编和裁汰，卫所军队不是被编入工程兵部队担任修路架桥的建设，就是改编成了建设兵团安置到蒙古和新疆，在大明北部西部边疆组建了一个个大型的国营军垦农场，这些兵团被称作预备役农师，这些农师在发展生产的同时，还负责当地的戎守。
保留下来的军队经过改编后，全部实现了火器化、职业化，无论是军事作战理念和作战方式，现在的大明军队，已经是一只不折不扣的现代化军队，水平相当于原时空十九世纪末欧洲强国的水平。军事改革以后，大明帝国拥有总兵力共一百八十万人的常备军，全国军队共划分了十二个大军区，三百多个军分区进行管理。
控制马六甲海峡以后，朱厚炜获得了丰厚的利润，有了充足的资金，他就不遗余力的发展海军。从弘治十八年开始，朱厚炜开始对沿海各个水师进行整编，海军的发展可以说是日新月异。截止到正德六年，大明海军纸面上的总兵力就超过二十多万，五大舰队共拥有各类大小舰船近万艘，其中包括五只海军陆战队。
实际上，这仅仅是纸面上的数据。这还不包括作为预备役，海军后勤部下辖的渔业总公司，如果把那些渔民也算进来，海军在编人员最少也超过五十万，用一句不客气的话讲，现在大明海军任何一个舰队拿到这个世界上，都是一股灭国的力量