这次招募新军，吴元清共为陈渊招得新兵三千名，正好为一营的兵力。在编制上，陈渊准备采用当年戚继光在蓟州练兵的形制：以12人为一队，有队长一人、3队为一旗，设旗总1名，共33人，3旗为一局，设局百总一名，共112人，四局为一司，设把总一人，共449人，2司为一部，设千总一人，共889人，合众为一营，设将官一名，中军一名，共2699人。
新军的将官统领自然是由吴元清充任，而中军陈渊是找来了榆林老将尤世威，三个千总分别由本地将门子弟侯世碌、侯拱极、候拱生担任。
而其余的基层军官，陈渊却是不打算在原有的军事体系中找了，他决定用自己的方法从新军中选拔。
一个正午时候，太阳毒辣异常，新兵营的士卒正在账中休息，突然军号响起，召集所有新兵集合。
“巡抚大人亲自阅兵，所有兵员速速到校场集合，疑迟者斩立决。巡抚大人亲自阅兵……”
由于没有基层军官，陈渊恐军令传达不到每个营房，于是便派号令兵骑马到各帐呼号，让每个士兵都能听到。
不一会儿，新兵从各帐钻出，三三两两的聚在了校场，因为这几天吴元清有对他们作过简单训练，所以还知道列队排列，整整齐齐，还算有摸有样。
陈渊端坐在校场上的高台之上，看到新军初具规模，十分满意，然后道：“开始吧。”
得到陈渊命令，刚才传令返回的号兵又纷纷骑着马围着校场跑，并呼号到：“没有命令不准谈言乱动，等待巡抚大人讲话。没有命令不准谈言乱动，等待巡抚大人讲话。没有……”
一条命令反复传达，可陈渊仍是不为所动，一直端坐在高台上。这个时候太阳正大，许多新兵站了许久已是热的不行，听到的仍是那句“没有命令不准谈言乱动……”的命令，不免有些心生不满起来。
“怎么回事啊，怎么巡抚大人还不说话?”
“是啊，这么热的天还让我们站这么久，不明显整人嘛！”
……
军阵之中慢慢开始躁动起来，其中有几个老油条最为嚣张，带头在阵中鼓吹谋乱，但马上就有督导队持棒将这些人拖了出来。
督导队是陈渊在原军队体系之外建立的新的军事机构，其中大部分成员都是经历战场的老兵，他们的职责就是监察士兵平日生活作风，以及战场督战。
在己巳之警中，勤王兵多次发生哗变，其根本原因是明朝军事组织松散，陈渊吸取