萧衍很重视对官吏的选拔任用，他要求地方的长官一定要清廉，经常亲自召见他们，训导他们遵守为国为民之道，清正廉明。
为了推行他的思想，萧衍还下诏书到全国，如果有小的县令政绩突出，可以升迁到大县里做县令。大县令有政绩就提拔到郡做太守。
他的政令实行起来以后，梁朝的统治状况得到显著改善，除此之外萧衍重视儒家思想，自己亲自写《春秋答问》等书，解答大臣们的疑问，示范了良好的向学风气。
萧衍对于宗室的宽纵，造成了一些不好的影响，其中有两个典型，一个是他的六弟临川王萧宏，一个是他的次子豫章王萧综。
萧宏在窝藏杀人凶手时，萧衍也不加惩罚反而加封官职，妄加纵容，萧宏也不知恩，更加肆无忌惮地胡作非为。
最后竟和自己的侄女，也就是萧衍的大女儿私通，两个人还谋划着要篡夺萧衍的皇位，结果派人刺杀萧衍时，事情败露，刺客被抓，最后处死。
萧衍的女儿知道自己罪孽深重，也没脸再见父亲于是自尽，萧衍没有怪罪萧宏，后来萧宏得病而死。
萧综的母亲吴淑媛原为东昏侯的妃子，后归于萧衍，仅七个月就生下了萧综，因此被认为是东昏侯的遗腹子。
萧综在南梁备受宠待，但吴淑媛自己失宠之后，出于对萧衍的怨恨，将萧综的身世告诉了他。
萧综自此疏远萧衍，后来更在梁魏交战时投奔北魏，改名萧缵，并表示为东昏侯斩衰三年。
萧衍听说后，非常生气，不但撤消其封号，还将吴淑媛废为庶人，后来萧衍听说萧综有回来的意思，就让吴淑媛给他送去小时候的衣服，但萧综却不愿意回来。
吴淑媛病逝之后，萧衍又起了恻隐之心，下诏恢复萧综的封号，赐吴淑媛谥号为敬，萧综落魄死于北方，萧衍取回了他的遗骨，以皇子身份陪葬于修陵。
萧衍晚年笃信佛法，郭祖深形容都下佛寺五百余所，穷极宏丽，僧尼十余万，资产丰沃。
普通八年三月八日，萧衍亲自第一次前往同泰寺舍身出家，三日后返回，大赦天下，改年号大通。
大通三年九月十五日，第二次至同泰寺举行四部无遮大会，脱下帝袍，换上僧衣，舍身出家，九月十六日讲解《大般涅槃经》。
二十五日由群臣捐钱一亿，向三宝祷告，请求赎回皇帝菩萨，二十七日萧衍还俗，大同十二年四月十日，萧衍第三次出家，这次群臣用两亿钱将其赎回。
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