复明营攻进剑州后，遭到守军的顽强抵抗。守军虽然丢失了城门，但迅速在将领的带领下，转入各个街道与复明营反复争夺。苟兴旺带人从东门绕向南门，并迅速占领南门后往城中猛攻，林可佳则直接带人从东门往城中猛。两人从两个方向往城中知州衙门方向攻去。
剑州知州田承遂急的团团转，怎么这明军说进城就进城了呢？没有接到过大清兵败的消息啊，上个月巡抚高民瞻还要求押送壮丁和粮草去保宁，说要去打成都。怎么成都没去打，现在明军到是打到家门口了。一边安排人去剑门关求援，一边让城里的兵丁竭力抵抗。
田承遂刚通知要衙役捕快，全部去攻打入城的明军，就有人来报说：“明军快打到衙门口里，”报信的人边说边拉着田承遂就要往北门退去。田承遂一把挣脱道：“我身为朝廷命官，怎么能够弃城而逃。既然城破唯有一死耳。”说完也不理报信的人，转入后堂自尽而死。
那报信的人见知州老爷在后堂死了，出门喊道：“知州老爷死了”这一喊，原本好顽强抵抗的士兵转头就跑，当官的都死了还打个屁。
抵抗的士兵一跑，林可佳带人很快就攻入知州衙门，然后苟兴旺向西门攻去，逃跑的兵丁边跑边喊，田承遂自杀的消息顿时传遍还在抵抗的守军。守卫门纷纷逃跑，眼看苟兴旺带人追到西门。又转头向北门逃去，等到苟兴旺杀散西门守卫，再杀到东门时，守卫也跑出城一大半了。
苟兴旺来不及去追逃走的兵丁，忙占领北门后开始肃清城里的残敌。等到城里肃清残敌后，让投降的剑州府衙吏员出榜安民。不一会儿林可佳也赶来汇合，苟兴旺道：“如今我们白天强攻剑州，怕剑门关那边很快就会知道，我觉得应该马上赶去夺取剑门关。”林可佳也同意，于是两人留下带伤的三百人，把从苍溪带来的两百壮丁也强行编入军队。然后两人带着剩下的六百人连夜往剑门关赶去。
苟兴旺带着军队走到后半夜就不能在往前走了，不是苟兴旺不着急，而是路太难走了。从出了剑州后，山势越发的险峻，已有多处道路旁边是悬崖峭壁，加上这时代的鸡眼盲。已经掉下山崖好几个士兵了，任由军官如何鞭打士兵就是不走，苟兴旺和林可佳实在没办法只好找了一处宽广的地方扎营歇息。
第二天天一亮，苟兴旺就催促军队前行。但还是走了两天，在第三天才远远的看见剑门关，等到苟兴旺看清剑门关所在的位置后，站的老远都感觉到心惊胆战，只见剑门关关城设于小剑山山顶的苦竹隘，关城东面深壑隔断，西