他们的从头改变中也有多次落错了锚点，跑到了别的平行世界中，甚至回来都差点成了问题。对同一个平行世界的所谓从头开始的干预，更是只有三十几次，这样的精准度已经达到目前的最高水平了，停留后穿越仓所设定的返程时间太短也是问题之一。
故此吴用开始了进一步的研究，只是内部刚刚完成肃清，而外部则面临着三大组织的追杀，这样的研究环境实在不咋地，除了吴用若是换二一个人只怕连抱有成功的希望都不敢想。但李志明则想得更多，如果自己成功了，那么自然科学研究院的人会不会中途插手呢？他们若是也干预起来，自己无论是在金钱上还是在能源上亦或是人员配备和战斗力上，可能都有所不敌，如此一来不如使个计策请君入瓮，毁了他们的穿越设备。
于是，李志明又做了一次无意义的时空回逆，果不其然自然科学研究院邀请黑雅以及卐的好手，也同样进行时空回逆，争取在过去消灭当下的李志明。过去的李志明不能动，动了就没有了基础，也就不存在时空回逆了，但当下的李志明无论他在过去还是未来，都可以杀死，只要杀死他，一切宛如毒蛇般不知何时会窜出来咬你一口的烦恼就彻底解决了。
李志明正是抓住了这样的心理，他在设计一个圈套，他要请君入瓮，不过这个圈套要冒不小的风险，因为他既是诱饵也是杀手。蔡枫催眠了李志明，漫长的三天催眠让李志明的精神力得到了无与伦比的提升，乃至他醒来的时候，眼睛中的光芒连旁人都能看得见。而吴用则再度使用仪器和药物，对李志明的异能进行提升。
那次的大战，只有李志明与程商两人，但结局却是他们杀掉了追杀者，抢夺了时空机器，并借助时空机回到了自然科学研究院总部，毁灭了所有机器然后从容撤离。从此，这个世界上也只有李志明一伙人掌握着时空的秘密，然而这却引发了三大组织更大的恐慌，李志明被宣布成为人类公敌，战争停止了一切的矛头指向了李志明，这让李志明的团队感到更加恐惧。然而有蔡枫的协助，大多数人都被成功洗脑，认为自己在做一件虽千万人吾往矣，笑对天下苍生却问心无愧的伟业。
当研发完成的时候，李志明他们已经被重重包围。所有的高科技武器都一同对向了他们，然而就在这时，时间静止了，他们在一种异样的净值中穿越来到了一个全新的平行世界。吴用的研发让他们可以无顺序在时空回逆中不断逆流，所有的一切都不再是按部就班的单程票。也就是说当他们做出一件改变的时候，他们会回到几年后看效果，如果是他们