战斗力低下。
眼下才天启初年，大部分的卫所，还存有相当一部分可转化为精锐的青壮官兵，这是个好事。
可从现在一直到历史上崇祯年间这个时间段里，卫所军队的腐化、废弛速度，令人咋舌！
根据后来发生的农民大暴乱来看，这些朝廷精锐的官军力量，一大部分都流入到流寇那边去了。
为避免这段时间精锐军事力量的迅速流失，卫所制度的取消，在未来的天启三年内，势在必行！
但问题来了，卫所是大明自建立起延续至今的基本军事制度，这样的军事制度如果想要取消，就必须要找到一个替代品。
这个替代品是什么？
营兵制！
其实，卫所还不是现代意义上的军营，不是战时组织，卫所军士世居一地，且耕且守，战时由朝廷临时调兵遣将。
朱元璋这样做，的确很适合明初刚刚建国时，大明强敌环伺，四处用兵的局面，可日至眼下，这种制度已经落后了。
营兵制，是最接近现代军营的军事制度！
卫所军屯的形式，直接导致兵将分离。
其后果就是兵不识将，将不识兵，武将在军中丧失威信，所以才会发生某地兵变，游击将军前去安抚，反被乱兵吊起射死这种奇葩事。
明初这种军事建设的蓝图，不久便因边患的日益加剧而改变，特别是九边重镇这些地区，临时性的调兵遣将更是家常便饭。
宣德年间，开始针对卫所制度有尝试性的改革，但都是点到即止，很少有太平皇帝肯去碰这种东西。
直到嘉靖年间，卫所制度才收到了第一次冲击。
先是山西、陕西两地总兵变成常设，而后，又将广东、广西、贵州、湖广原本的两名总兵，增设为四名总兵，改福建、保定副总兵为总兵。
万历年间，增设总兵于临洮、山海关。
在天启元年，朱由校也曾增设登莱巡抚，专为东江镇提供物资支持，相应的，登莱总兵一职也在几月后登场，这些都阴差阳错造成了军事制度的改变。
其实到现在，经过宣德、嘉靖几代帝王的努力，明代的卫所军事制度，已经悄然发生了变化。
总兵官已然取代原来都指挥使的地位，成为地方最高武职官员。
“洪永以后，边患日棘，大将之设，遂成常员。镇守权重，都统势轻，卫所精锐，悉从抽选，于是正奇参守之官设而卫所徒存老家之名。”