不过在动乱时期，少林和尚也不是只在山中念佛，有时候也会手持兵器保家卫国。
特别是在明朝时期，辅助戚继光俞大猷剿灭倭寇，使得倭寇看到光头就跑，可见这些和尚的战斗力，也间接说明少林和尚功劳不小。
这些少林和尚其实也挺有骨气，因为不肯与异族合流，自元以来不立方丈，私下里曾有不少弟子参与抗元的斗争。
后来明朝建立之后，少林又重新选出方丈执掌寺庙，可到了清军入关之后，少林和尚又将方丈之职卸去，一直到现在还不曾立起。
至于为什么少林和尚的功夫这么高明，其实这一点很好解释。
自古以来，出家人的功夫都较之红尘中人的功夫普遍高明不少，其主要原因就是因为这些出家人不事生产，无有子嗣，又没有别的烦恼缠身，因此练武参佛成了他们一辈子都在做的事情。
若是一个人一辈子都在做一件事，那么这件事定然会被他做到了极致。
少林和尚功夫高深，原因就在这里。
同理，出家在外隐居深山的道人的功夫也很高明。
修行中人最不可或缺的就是财、侣、法、地四大要素，这四种要素寻常人欲求一种都不可得，而这些和尚却一样不缺，练起功夫来，自然是勇猛精进，远超同侪。
只是少林寺的风光也就截止到清朝之前，待到满清入关，火烧少林之后，少林寺便眼见的衰落了起来，待到新朝建立之前，少林寺又经历了一次战火，整个寺庙几乎全都被烧光，达摩堂的、藏经阁也都付之一炬。
到如今只留下几间院落勉强可以安身，最近修建的大雄宝殿还是院子里的几个老和尚化了十来年缘，求了附近好多善男善女，才找工匠修建了起来。
这座大雄宝殿建成之后，少林寺和尚化缘的钱已经一分不剩，还欠了建筑队三万多。
建筑队的工头只要有空就来这里要账，生怕这些和尚还不上，到后来便开始在庙外骂街，污言秽语粗口爆个不停，整个寺庙里的和尚只能口诵佛号硬挺挺的听着，不敢还一句口。
也就是被逼到了这个程度，方正这才派慧珠和尚去海外传法，务必为少林留下一点香火，不然的话，恐怕百年之后，世间再无少林。
郭大路第一次来到少林寺的时候，正好见到一个小青年来少林寺拜师，但方正老和尚却不愿意收他为徒，因为少林寺太穷了，老和尚怕养不活这个徒弟。可见当时的少林寺穷到了什么地步。