吴天德在逃出爪哇岛后，他们立刻就意识到，鬼哭岛据点中的鼠疫样本很可能会与那些无知的土人接触，从而将鼠疫这头恶魔释放出来。做为鼠疫的研究人，没有人比吴天德他们更明白多种鼠疫集中爆发的可怕性。
也正是因为如此，他们立刻找到捕奴协会在爪哇人负责人，严令他们将所有据点全都撤出爪哇，最好能做到岛上不留下一个汉人。这个命令在别人看来有些荒谬，但是吴天德身上却有李愔签署的特别手令，这是让他在紧急情况下，可以调集齐王府的官方或非官方力量，刚好捕奴协会也包括在内。
也正是如此，所以捕奴协会立刻行动起来，开始抓紧时间将爪哇岛上的汉人撤离，而且这些汉人也不能自由离开，而是运到了一处封闭的小岛上观察，只有等到他们之中没有鼠疫爆发时，才能从岛上离开。
也幸好因为之前东爪哇和中爪哇的暴乱，使得岛上的汉人要么撤离，要么集中在大的据点里，所以撤离行动很顺利，不过即便是这样，最后两个撤离的据点还是受到鼠疫的波及，其中已经有人出现了发病的症状，所以最后一批人被单独安置在另外的岛上，并且由吴天德他们这些专家诊治，尽可能的挽救这些人的生命。
除了据点中的汉人，另外在西爪哇那里，还有一万的倭军和一万的三韩军队，他们正在镇压西爪哇的暴乱。而当这两支军队的指挥官接到消息时，他们已经深入到西爪哇的内部。所以撤离出来的时间也最晚，甚至在组织登船时。军队中已经有人因为染上鼠疫而死亡。
也正是因为如此，他们同样被单独安置。两万人被分成三部分，一部分是已经出现症状的人，另外则是被怀疑染病的士卒，最后则是没有出现任何情况的士卒。部分的士卒被安排在三个独立的小岛上，按照吴天德他们提供的预防和治疗方法治疗。
只不过这两万军队撤离的时间实在太晚了，最后确认染上鼠疫的士卒达到一万两千三百六十二人，而在这一万多人中，哪怕是他们接受了吴天德他们研究出来的治疗方法，但是鼠疫这种病本来就应当以预防为主。当出现发病时，再治疗就已经有些晚了。所以最后染病的一万多人中，能活下来的只有一千五百七十六人，致死率高达百分之九十以上。
以上还是经过吴天德这些鼠疫研究专家救治的结果，而在爪哇岛这种医疗条件落后的情况下，鼠疫的致死率只会更高，甚至可以说，只要是染上鼠疫之后，几乎只有等死这一条路可走。
对于吴天德等人采取的紧急撤离措施。李愔