时候，朝廷发出公文，要求各地所有学校和讲学之所必须悬挂皇帝像，并将皇帝的学说纳入必修课程。皇帝在日理万机的闲暇，也与申时行讨论一些历史唯物主义、辩证唯物主义，以及宇宙观、进化论等内容。
尽管只鳞片爪，但申时行领导着翰林院呢，自有大儒为皇帝辩经。他们将古往今来能与皇帝思想对应的古文翻找出来，表明皇帝思想源流上古并振隳发扬，言辞质朴而博大精深。因事关重大，朱翊钧很大一部分精力要放在这方面，称得上殚精竭虑。
另一方面，皇帝也下批示给皇家科学院，组建地理、考古和生物考察队等，满世界寻找能够论证皇帝理论的实物证据。但有发现，朝廷的宣传机器就会动员起来，反复证明其理论的合理性。
一时间，申时行圣眷日隆，红得发紫。梁梦龙心下着慌，带着政改专班日夜研究新的政改方案，寻到机会就与皇帝讨论。见申、梁二人如此，许国就把行在奏章批答的事情多干些，在圣眷上也不输二人多少。
万历十六年七月，潘晟因病致仕，赐二等伯爵，皇帝书赠“休休有容”，并许驰驿，政事堂再次缺人。朱翊钧经过深思熟虑，并与梁梦龙商量，将王锡爵荐推入政事堂。
此时皇帝卤簿大驾正在苏州。王锡爵入阁后，又以伴驾之功被皇帝给假半月，用以夸耀乡里。
苏州作为天下首郡，有明以来，大概上缴了朝廷全部钱粮、税款的十分之一。皇帝让王锡爵入阁并给假，令这个早就不堪重负的经济重镇士气大振。
虽然王锡爵全力以赴的低调，但整个苏州城仍轰动了。王锡爵家中喜气洋洋不提，这个苏州城都因为皇帝的善意而张灯结彩。
朱翊钧在苏州游玩了两天，在接见知府时，又赐字“浩浩姑苏”，以表彰苏州府在大明立国之后的功绩。
同时，皇帝大笔一挥，将历年积欠一概减免，从根源上消除了官府利用积欠欺压苏州地主的可能——反正这些积欠已经欠了一百多年，早就收不上来了。
八月桂花飘香的时节。南京占地超过一千五百亩的魏巍皇城再次迎来了帝国的主人。
自武宗南巡以后，朱翊钧是再次到达南京的皇帝。江南一代耄耋老人依稀还记得，武宗南巡带来根植于他们童年的恐惧。
从武宗当年随心所欲的扰民、勒索过程中，江南人大概形成了一种模糊概念，也许皇帝这东西本身是邪恶和荒诞的。它不是人民的慈父，相反——这东西反倒是恶贼，也许没有它更好咯。
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