，想要对抗这支西班牙远征舰队，至少要集中三百艘战船，而且至少也要全是四百料以上的大船才行。虽然郑芝龙的战船号称数以千计，其实大部份都是商船，最多架上两门炮，就成了战船，想要凑齐三百艘战船，也不是短时间的事情。于是也立刻下令，调集船只。
结果还没等郑芝龙凑齐战船，就又听到消息，西班牙远征军巳经被浙江的明军击败了。这下郑芝龙也吃惊不小，而且还有些半信半疑，他和这个时代的大多中国人不同，对海外的世界十分了解，仅仅只是浙江的明军，怎么可能击败西班牙远征军呢？因此又派人到浙江打探。
商毅击败西班牙远征军的消息在明朝虽然没有引起什么轰动，但在浙江还是颇有些影响力的，因此郑芝龙很快就打听到了商家军击败西班牙远征军的整个过程，虽然其中不乏夸大其词，但也有五六分真实。郑芝龙虽然觉得有些难以理解，但事实己经摆在眼前，也不由他不信。同时也注意到商毅这个人。
当然这个时候商毅才刚刚始建立海军，还没有向海外扩张，打败西班牙远征军，也是靠的陆战，因此郑芝龙对他也并没有生出警惕之心。
但在过年之后，商毅进军台湾，逐驱西班牙，与荷兰人达成共驻台湾，以及贸易的协议等等消息，也都陆续传到了郑芝龙的耳中，这才让郑芝龙生出戒意来。因此也派人重点打探商毅的情况，不仅了解了商毅过去的一系列战绩，己佳占稳了浙江，还进入苏州的丝绸业，而且还知道现在商毅的手下不仅有一支规模颇大的海军，同时还在杭州建立了造船厂，向海外扩张的意图己经十分明显了，郑芝龙这才感觉到商毅的危胁。
按照郑鸿逵的打算，应该立刻出兵，攻打台湾，把基隆夺过来，并狠狠教训商毅一顿，也让他知道，在海面上是郑家说了算，在郑家持这种观点的人也不在少数。
但郑芝龙到底要比别人考虑得深了一层，他知道商毅不同于自己以前的敌人，在过去，无论是刘香还是李魁奇，都是海盗身份，而郑芝龙接受了明朝的招安之后，摇身一变也成为朝廷官员，不仅能在沿海获得立足之地，用时也得到了明朝在人力物力上的大力支持，因此在与他们的海上争斗中，也占尽了优势，最终成为最后的嬴家，对荷兰人的战斗也同样是如此。在这一点上，郑芝龙比刘香、李魁奇等人明显要高明得多。
因为商毅也是朝廷官员，官职比郑芝龙还高，在朝中似乎还有不小的靠山，同时商毅还是浙江总兵，郑芝龙有很大一部份商品都是从浙江购买，一但和商毅恶交，