个运需队的死伤十分惨重。
不过鳌拜虽然好战，但绝不是有勇无谋的莽夫，也知道自己就带了这三千骑兵，一但商家军的大军赶到，把自己包围起来，恐怕也不好对付，起码商家军的战斗力比过去的明军还是要高那么一点点，反正这一战是赢了，见好就收吧，因此立刻下令撤退回南京。
结果等商家军的援军赶到战场时，清军早就跑远了，只留下一地的尸体和被清军烧毁了大半的物资。结果这一战商家军士兵战死的人数达到八百七十三人，伤三百六十二人。民夫死亡的人数为二千五百二十七人，伤一千二百八十一人。而清军仅仅只损失了三十七名骑兵。在商家军与清军的交战史中，这样的惨败还是绝无仅有的。
商毅闻报之后，也确实吃惊不小，立刻将这一战当做反面教材，通告全军，要求其他各部队一定不能再有大意、轻敌、麻痹的思想，一定加强巡逻、侦察、守备的兵力，而且在进攻时，要留意清军突然主动发起进攻，夜间也要防备清军的偷袭。同时对死亡、受伤的民夫进行厚恤。
但这一次失败有相当的偶然性，并不能攺变目前战场的势形，对全军的士气也沒有造成什么影响，同时在第二天下午，清军在南京城外的天坛据点也被商家军攻占。南京城的外围阵地也基本被扫清了。
就在第三天，商家军的第一、二、三军同时出击，开始向南京城墙发动进攻。
第一军进攻的南京南面的聚宝门，通济门、正阳门，第二军进攻西面的石城门和三山门，第三军攻击北边的神策门、太平门。三路人马一共集中了近十万的兵力，同时向南京的七座城门。对南京的攻势也全面展开。
多铎精心布置的南京城外围防线仅坚持了两天时间，就宣告基本土崩瓦解了，而且清军也损失了不少的兵力，多铎也不得不把神烈山的守军抽调回一半协助守城。这时在南京城里驻守的清军仅仅只有八万五千多人，除去临时征编的民兵之外，实际的兵力己不足七万。
明朝的南京城墙一共有十三个城门，虽然商家军只进攻其中的七个城门，但不等于其他城门都可以不设防，多铎在七个受到商家军进攻的城门分派了五千人驻守，而另六个没有受到攻击的城门也分派了二千人驻守，还剩余二万多人作为预备兵力，这样才算是免强把南京的城墙给守住。
不过甴于南京城墙本来就十分高厚坚固，这个时代的火炮几乎根本不可能催毁得了，而且城墙基本都是沿着秦淮外河修筑，也很难使用坑道爆破的方法来炸开，只能用最原始