事上来说，也要尽量避免这种双线作战的局面出现。
因此现在摆在商毅面前的两条路，一是修正自己的计划，改成先南后北，先扫平南方的这些残明势力，然后再向北和清廷作战。而另一条路则是修复自己和南明三政权的关系，稳住他们，等打完淸廷之后，再来收拾他们。
不过这两条路都有各问题，选择第一条，虽然以自己的力量，灭掉这些残明势力并不难，但却很耗时，因为这三个南明政权所在的广东、福建、广西都是山多林密的地方，而且气候水土和长江流域大不相同，闽南地区在中国古代一向都是用兵的禁区，最大的敌人就是气候水土，非战斗减员是非常可怕的，十停之中，往往拆损二三停。
在另一时空里，清廷足花了二十余年的时间，才发南明势力基本清除干净，虽然说自己的实力要强过清廷，但二三年时间总是要的，而在平定了这些地方之后，还需要时间来稳定恢复，这一拖就是五六年了，而在这段时间里，也足够清廷缓过这口气来。
而选第二条看似简单，毕竟自己的兵势太过强盛，而且这三个政权都是不思进取的，自己不打他们，己经是谢天谢地谢人了，恐怕没人敢和自己真正为敌，因此修复和他们的关系并不算难。
但这样一来在自己背后总是一个不安稳的因素，如果只有永历、绍武两朝到还好一点，永历朝廷內耗不断，又没有可堪大用的将材，因此难有做为；而绍武朝廷的郑成功和自己的关系非同一般，在有清廷这个共同的敌人存在时，不会轻易和自己翻脸，但现在又多了一个永安政权，商毅对尚可喜还是有点但心。因为他和清廷的关系太过密切，而手下的部队也有一定的战斗力，也是最大的麻烦。
因此商毅在一时之间也难以做出选择来。这时叶瑶瑱道：“相公，反正也不急于一时，明天就要出发去南京了，等到了南京安顿下来之后，再和大伙儿一起商量吧。”
商毅一想也对，反正这也不是要马上决定的事，慢慢的想，也可以和众人多商议，多权衡一下利憋，再做决定也不迟。于是商毅也点了点头，道：“说的也对。”又对明石姬：“以后要多关注一下南方的情况，一有新的消息，就马上通告给我。”
――――――――分割线―――――――――分割线――――――――到了第二天，商毅一行的大队人马终于从杭州出发，赶奔向南京。一路无事，在六月十八日这一天，商毅等人的车队到达了南京，由正南的聚宝门进城。
先期到达南京的官员在李岩的率领