停放二号机原型机的机房中，实验室中大量的电子屏上显示着测试者的各项身体数据。而明日香在所有的克隆体制中，拥有着最好的身体素质。即便没有受过系统性的训练，身体素质也如同是久经训练的战士一般。
这是解开了基因锁之后，体内的基因对自身的身体进行了自行调整。不光是身体素质，包括身材和容貌也都会进行优化，如果能够进行对比的话就会发现两次轮回之中。碇真嗣和明日香都比上一次轮回稍微好看了一些。
这种优秀的身体素质在同龄人之中，可以说是独一无二的，但光是有这一点是不够的，真正能否驾驶二号机，最重要的还是取决于与二号机之间的同步率。
虽然训练可以将同步率提升少许，但这东西更多的是取决于天生，天生的同步率如果不够高的话，就算再怎么训练，也难以成为一名合格的驾驶员。
而随着同步的开始，明日香与二号机之间的同步率起初相当之低，几乎是无法同步的状态，通常情况下，只有内心比较封闭的孩子，才会和机体有比较高的同步率。
但随着神经连接的深度加深，二号机与明日香的精神开始有了较为紧密的连接和碰撞，这让明日香下意识感到了危险，与此同时，一直以来都沉寂着的基因锁这个时候却突然爆发了出来。
随着基因锁裂开一道缝隙，明日香的潜力被部分的开发了出来，与此同时，原本一直维持在百分之十以下的同步率飞快标准，只是眨眼间就突破了一半，紧接着直奔百分之九十而去，这是经过了专业的训练之后都难以达到的同步率，直逼百分之百。
同时只是一个血肉骨架的二号机，竟然缓缓的动了起来，眼看竟然要从固定它的架子上挣脱下来。
“不好！同步率过高，快断开连接。”
负责监控连接深度的工作人员满头冷汗：“不行，断开失败，无法执行紧急协议，驾驶员有着强烈敌意，我们对她内心的窥探似乎被他当成了一种攻击！”
“那就快点启用备用预桉！释放液氮，将机体冰冻。”站在最高处的实验负责人当机立断，下达了紧急措施的命令。
与此同时，二号机所在的房间之中大量液氮喷射出来。这些用奇怪生物的血肉制造的机甲本身就拥有着失控的危险，因此在实验设施之中，时刻都有保护措施。
第三新东京市的保护措施是坚固的合金防御墙壁，即便是失控的零号机，疯狂的对墙壁进行攻击，也无法打破。而德国的实验基地采用的就是大量的