；二氧化硅晶粒小于几微米时，就组成玉髓、燧石、次生石英岩。
矿物质成分：针铁矿、赤铁矿、金红石、磁铁矿、电气石、石榴石、云母、绿泥石等形成了包裹体水晶，如发晶、钛晶、绿幽灵等，发晶中则含有肉眼可见的似头发状的针状矿物的包裹体形成。
含锰和铁者称紫水晶；含铁者(；呈金黄色或柠檬色 )称黄水晶；含锰和钛呈玫瑰色者称蔷薇石英，即粉水晶；烟色者称烟水晶；褐色者称茶晶；黑色透明者称为墨晶。
结构形态：结晶完美的水晶晶体属三方晶系。常呈六棱柱状晶体，，柱面横纹发育。柱体为一头尖或两头尖，多条长柱体连结在一块，通称晶簇，美丽而壮观，形状可谓是千姿百态。
光学性质：颜色：水晶的颜色可有无色、紫色、黄色、粉红色、绿色、蓝色及不同程度的褐色直到黑色。
光泽及透明度：玻璃光泽，断口可具油脂光泽。透明，随内含物的增多或有色水晶颜色的加深。透明度降低。
光性：一轴晶正光性，正交偏光下所看到的一轴晶干涉图是独特的，其黑十字臂未达中心。形成中空的图案，俗称牛眼干涉图。中心部分通常为淡绿色或淡粉色。
折射率及双折射率：折射率1.544-1.553，双折射率0.009。色散0.013。
多色性:无色水晶没有多色性。有色水晶有弱到强的多色性.表现为体色的不同深浅。
力学性质：解理：无解理,有典型的贝壳状断口。所谓解理是指矿物被打击时，沿一定方向有规则地裂开形成光滑平面的性质。
根据解理的程度可以分为五类：极完全解理、完全解理、中等解理、不完全解理和无解理。水晶属于无解理。
硬度：摩氏硬度7。为摩氏硬度，相当于钢锉一般坚硬。
密度：2.66（0.03，0.02）g/cm3。这意味着一定体积水晶的重量，是相同体积水的重量的2.56-2.66倍,块状变种水晶密度可能稍高些。
压电性：水晶晶体受到压力时会产生电荷,反之，受到电压作用时，晶体会产生频率很高的振动。水晶具有可使压力与电荷相互转移的性能，称压电性。
睡觉条形色：无色,矿物粉末的颜色叫条痕,它可以消除假色，减弱他色。保留自色，是比矿物的颜色更为可靠的鉴定特征之一。
透明标准：水晶透明度与透过它的光的质与量有关。光线透明过厚度为1厘米以上的水晶碎