联-合-国环境与发展会议，通过了影响深远的《二十一世纪议程》。
《二十一世纪议程》在其第18章“保护淡水资源的质量和供应:对水资源的开发、管理和利用采用综合性办法”中专门就水资源的综合开发与管理。水资源评价，水资源、水质和水生生态系统的保护等做了详尽的建议和规定，以期达到满足所有各国在实现可持续的发展方面对淡水的需求。
《二十一世纪议程》规定必须对水资源进行统筹规划和管理这种统筹规划必须覆盖所有各类的相关淡水水体,包括地表水和地下水同时需要适当考虑到水的量与质方面。
而水资源综合管理的依据构想是,水是生态系统的组成部分水是一种自然资源,也是一种社会物品和有价物品水资源的数量和质量决定了它的用途性质。
对国际河流生态系统保护最为有力的当为《国-际-水-道-非-航-行-利-用-法律-公约》。负责发展和编纂国际法的联-合-国-国-际法-委-员-会-于1981年开始制定关于国际水道非航行利用的法律。
1990年它通过了关于国际水环境保护的条款。1997年5月5日，根据国际法委员会的条款，联-合-国大会通过《国-际-水道非航行利用法律公约》。
这个框架公约包括四类条款：适用于所有国际水道的一般规则（第510条），实施这些规则的程序规则（第1119条和第2932条）。关于淡水保护、保持和管理的实质条款（第2028条）。关于水道国缔结协定的条款（第34条）。
公约规定,水道国应在其各自的领土内以公平合理的方式利用国际水道以使国际水道得到最适宜的和持续的利用,从而充分保护国际水道。
此外水道国应参与以公平合理的方式利用、开发和保护国际水道,并有义务在保护和开发国际水道方面进行合作。
各国有义务采取一切适当的措施防止对其他水道国造成重大损害，任何造成这种损害的国家应与受影响的国家进行协商排除或减少这种损害,并在必要时讨论赔偿损失问题。
公约要求水道国保护、保全和管理国际水道及其水质,特别是保护水道的生态系统。
公约倡导的措施包括:
a. 确定共同的水质目标和排放标准针对集中和分散的污染源采取适当的技术和方法,确定应被禁止、限制或监控引入水道的物质的清单。
b.保护水道的生物资源应当是防治污染的目标。