徐光启入阁之后，萧如薰将自然灾害问题全部托付给了陈龙正。
命令他分管这些新近成立的重要办事部门，托付大事，内阁的压力也得到了一定程度的减轻，萧如薰为北伐期间打造的政治班子也更加稳定。
同时，还培养了两名阁臣候补者，一个是陈龙正，一个是负责灭螺的方从哲。
方从哲的灭螺治病的工作开展的不错，在中央医部的配合之下，付出了大量倭人的性命之后，强行将东南三省的血吸虫病给控制住了。
而在治疗方面，他也聚集了大量医者的力量，按照中央给出的乡村游医的指导思想，培养了一大批学会治疗血吸虫病的乡村游医，让这些人跟着医者们一起下乡，一个村子一个村子的给患者诊治。
不说挽救了多少人，而是在几年的大手笔治疗之下，将东南三省的血吸虫病控制住了，将大秦的钱袋子给保住了。
不止如此，方从哲还主持派出大批倭人在整个长江沿岸虫灾区大量灭螺，一边消耗倭人，一边消灭钉螺，极大的降低了人们继续感染血吸虫病的概率。
从这些角度上来说，萧如薰觉得方从哲是个非常不错的循吏，办事得力，乖巧听话，没有强硬的性格，对待皇帝极为恭敬顺从，如此的性格和能耐怎么能不受到皇帝的喜爱呢？
萧如薰屡次下旨褒奖方从哲，给他提升官位和勋位，给他树立起一定的威望，为他进入内阁做准备。
与此同时，医部和农业部合作建立起了第一批的大秦官方的药材种植基地。
重要当中很多药材都要相当的年份种植起来才好用，药性才足够，不过也有很多药材并不需要很多时间来种植，这些事情交给医部的医者们来统筹。
萧如薰要求医部办到药材随取随用，不说完全够用，至少不要再遇到以前那种有人没药的困境。
在大规模的种植之中掌握技巧，缩减成本，逐渐让平民百姓都看得起病，吃得起药，这十分重要。
而且这些药材基地还能给军队提供很大的助力，军队里每战都会产生大量的伤病员，消耗的药材量十分之大，萧如薰过去就很关注士兵医疗的问题，所以在军队医疗方面从来不曾放松过。
在此过程之中，萧如薰将大量的粮食物资向甘肃关中还有辽东运送囤积，给军队提供足够的后勤保障。
这场战斗，萧如薰预计出动十万骑兵和十万步卒，主力是西北兵团和关中兵团，萧如薰还会带领京畿兵团和禁卫军之中的骑兵加入战争，