教并举同进，大道疏同三教合一的思想，也在这个时代由此产生。但是，
伴随着宋以后文人士大夫的地位独尊的水涨船高，而对外的积弱无力和威胁，儒学也逐步走向注重夷夏之防，保守倾向的原教旨主义化，主张克己复礼，认为回归最原始的儒家思想，把大家都教化成圣人就可以解决一切问题了，造成儒学务实性的空泛化和教条主义的泛滥。
自然，许多至圣先师孔子都没办法决绝的问题，妄想用儒家的大道理一概论之，这本身就是一个大笑话，其目的只是为了满足个人，造神封圣的欲望和渴求，所以说朱熹之流绝对是一代大教育家，大思想家，但他本身的品德，并不值得让人恭维，将儒家引上原教旨主义歧路，也是他的责任。
孔子主张“有教无类，万事师表”当圣人来膜拜也没什么。
只是后世不免有歪嘴巴和尚念乱了经，是以孔子号称中国历史上黑锅之王，基本后人有想党同伐异，都要伪托圣人言，拿他扯虎皮做大旗，
儒家原教旨主义运动，在这个叫朱熹的学术恐怖分子时期达到登峰造极，他以及他的弟子，以正本清源之名，发起了了对孔子的封神运动，按自己的意思重新解释四书五经（我们现在儒学都来自朱版注释），进一步把儒家儒学，彻底宗教化，神学化，将自己封为儒教教主，方便以圣人之名，堂同伐异，剪除异己，消灭一切敢于质疑和声音和存在的一种工具。
所谓史称三千年儒学，自朱熹前那叫儒家，自朱熹后就有了儒教，孔子为神明，朱子为教主。
原教旨主义其最大的特征，就盲目的狂信，只要通过修习和理会古时圣人或者经典的思想，就可以解决世间一切的问题，如果解决不了，那绝对不是教义的问题，只是你儒教信仰的不够。或是你修养不足，读书不精，至于任何与之相违的想法，那都是异端邪说。
是以史称“宋后八百年经史，世间论语，皆出朱子注云”
伊斯兰化原教旨主义的产物，就是从山中老人的阿撒辛刺客团，发展到满世界跑的人体炸弹，汽车炸弹。原教旨主义的天主教，则催生了大名鼎鼎的十字军东征，臭名昭著的宗教裁判所和异端毁灭运动，而有中国特色的儒家原教旨主义，勇于内斗而怯于外敌，把军人当成最卑下的职业，把当四等奴隶的历史当成伟大的民族大融合，把口口声声奴才的时代，当成盛世
因此在唐一代的儒学，因为其学源杂驳，百家纷说，官定的六学二馆，除了经学以外，医学、算学、律学、书学诸科并举