清末到民国有三次废除中医的号召，1879年，清末国学泰斗俞樾先生在其《废医论》中首次明确建议废除中医。俞樾先生认为中医的所有理论均建立在阴阳五行之上，辅以一些肺腑经络的学说，这是一件非常荒谬且愚昧的事情。
梁启超、严复和***都曾经支持过这一理论，俞樾和严复已算是较为理性派，比如俞樾先生晚年的著作《医学说》则认为“医可废，而药不可废”，日后在网上盛行的中医废医不废药的理论就是源于他的学说。
而后两位则是激烈派，梁启超就曾激烈的抨击中医为，“学术界之耻辱，莫此为甚矣！”***更是在《新青年》报上撰文，“不解人身之构造，不事药性之分析，惟知附会五行生克寒热阴阳之说，其术殆与矢人同科。”在***看来“杀人以中医与弓，有以异乎？”
到了1912年，北洋政府颁布《壬子癸丑学制》，并将中医排除在正规教育系统之外，教育总长汪大燮公开表示，“吾国医毫无科学概要根据、余决意今后废去中医，不用中药。所请立案一节，难以照准。”
而后北伐成功，1929年，南京国民政府中央卫生会议做出“以四十年为期，逐步废除中医”的决定，这便是第三次废除“中医”。
但是他们都没有解决一个问题，那就是没有了中医中药，中国四万万老百姓到底怎么办？陡然之间国家能提供那么多合格的西医西药么？那些政策的制定者倒是不愁没有西医给他们看病，没有西药吃，甚至他们之中不少人都当起了买办，通过进口销售西药发了大财，但那些普普通通的老百姓可吃不起西药也看不起西医。
所以，这几条禁令成了废纸一张，中医中药依旧盛行于世，到了建国后，又重新恢复了中医中药，中医和中药才有了现在的发展，虽然中医中药有着种种问题，但全国这么多人总是要看病吃药的，这才是最重要的问题。
可是这并不意味着中医就没有问题，以前西方也用“四体液病理学说”，倒是和中国的阴阳五行理论差不多，但随着科技的发展，现在西方的医学理论大大进步，早已摈弃了“四体液病理学说”，诞生了病理学、细菌学等多种理论，而中医依旧使用古老的阴阳五行，这显然不符合时代的发展需要。
后世有人这么形容中医中药，在科学上这种情况被称之为黑箱理论，黑箱是指内部结构和作用机制尚不了解的系统，白箱是指内部结构和作用机制已经了解清楚的系统；中医的确有效，但是为什么有效却始终没有完美的解释。