国昭雪，恢复官职，并让他们办理军中事务。建议启用辽人原赞画主事刘国缙为登莱招练副使，夔州同知佟卜年为登莱监军佥事，原临洮推官洪敷教为职方主事，军前赞画，用以收拢辽人的心。
天启皇帝对于熊廷弼所有的奏请一律批准。
到了七月二日这一天，熊廷弼拜别天启皇帝朱由校，启程赶赴辽东。
天启皇帝特地赐给熊廷弼一身麒麟官服，并赠四枚彩币。
天启皇帝专门为熊廷弼在京城郊外十里长亭设宴，并派文武大臣为熊廷弼践行，这在明朝可谓极为稀有的礼遇。为保熊廷弼的安全，朱由校专门派了五千名京营选锋，护送熊廷弼一直到辽东。（最后这批人成为了熊廷弼在辽东唯一可以调动的军队）
朱由校对于自己的安排十分满意，但他不知道将熊廷弼升任兵部尚书一事，得罪了一个人，张鹤鸣。
这位在短短三个月便升任兵部侍郎的张鹤鸣，心中对于朱由校十分不满。
张鹤鸣原来是贵州巡抚，由于辽阳失守，天启皇帝临时抓了兵部右侍郎张经世统领两万军兵出山海关，支援薛国用。
兵部没有了侍郎，就有人推荐张鹤鸣来充任兵部侍郎。
没几天，兵部尚书崔景荣辞职，天启皇帝把快八十的王象乾招入京城，命他接任兵部尚书。
王象乾当着天启皇帝的面，陈述自己年龄大了，眼睛都看不见了，实在不能在兵部主事。
但是天启皇帝难得将这个老头子招进了京城，自然不会轻易放过他。天启皇帝向王象乾询问辽东战局如何对应，王象乾一时高兴说出了如何镇守关外诸镇，如何招抚少数民族，并安cha汉人在少数民族内部的方略。
天启皇帝听了之后对王老头大加赞赏。这时恰逢蓟辽总督文球告老还乡，朱由校就加封王象乾蓟辽总督兼右都御史，总督蓟辽军务。
朱由校还特别关照王象乾：“年纪大了，没关系。只要活着，能领官饷就行。眼睛看不见，也没关系，给你派个文秘，替你写奏折，读报告。”
王象乾见推辞不过，只得上任了。
京城内兵部尚书的位置又空了出来，张鹤鸣看了看身边左右，这一次只怕非我莫属了吧。哪知，熊廷弼刚到京城，天启皇帝就任命熊廷弼为兵部尚书，这让张鹤鸣十分不悦。
朱由校得罪张鹤鸣，张鹤鸣自然不敢与皇帝计较，但他对熊廷弼算是恨上了。而且张鹤鸣与熊廷弼早就熟识，熊廷弼在张鹤鸣的面前向来喜欢吹胡子、瞪