宴会结束后，李斯回到家中，想到秦国实行郡县制已经八、九年了，国家稳序发展，各行各业百废待兴。可万万没有想到还有人反对郡县制，这真是太不合时宜了。忽然有人报告：“补射周青臣来见。”李斯就让周青臣进见。周青臣进来后，行礼道：“丞相啊，今天淳于越也太狂妄了，他竟敢还提分封制，这不是和丞相做对吗？假如陛下真的听取他的建议实行分封制，那么丞相多年来主持的郡县新局不就毁于一旦了？”李斯拍案怒道：“周大人请放心吧，本相绝不会让淳于越的阴谋得逞！”说罢就让周青臣磨墨，自己挥笔疾书，一气呵成，写成了一道奏折。李斯写完，让周青臣阅读了一遍。周青臣看完，满脸堆笑，不停地说好。
次日早朝，大臣都把写好的奏折一一呈了上去。秦始皇开始览阅，有称赞郡县制好的，也有称赞分封制好的，真是各抒己见，莫衷一是。秦始皇最后看李斯的奏折，上面写道：
臣李斯冒死向皇帝陛下进言：周朝之时，天下诸侯，混战不休，这正是因为侯王太多的缘故。诸侯国多了，他们的言论和学说就会杂乱无章，诸子门派众多，他们用虚假的言词来掩饰战乱的过失，造成了言论的高度自由，以至于出现了随意批评各国时政的不良习惯，这些学者们还经常妄加评论周天子和诸侯王，常常使国君们陷入窘迫的境界。现在天下统一了，国家之事就应该由皇帝一人决定，人们再如果按照诸子的学说来任意地针砭时政，就是非常错误的，一定要坚决制止。
现在民间的私人学馆，都有各自的学习内容。这些内容与秦国的法令、条文、制度也不相吻合，所以人们看到朝廷的法令就喜欢用自己学到的百家观点妄加评论，总认为秦国的法律条文漏洞百出，不值得推敲。百姓在家大发议论，走出家门还要信口雌黄。这些人从表面上看是夸赞陛下，而实际上确实同陛下唱反调，他们在亵渎美政。长此下去，百姓们的思想就会混乱，陛下的威信也会下降，而民间的反对派和六国的旧势力也会趁势抬头。因此陛下应先发制人，提前制止言论的自由，先把那些异端分子坚决压制住，这样人们的思想就不会混乱了。
那么怎样才能统一思想呢？臣冒死献上一策：书是一切思想的来源，只有断绝了来源，人们的思想就会枯竭，因此臣请求把秦国以外的所有图书典籍全部焚毁，这主要是六国诸子的全部著作，尤其是孔、孟的书。具体的措施是除了朝廷的博士官可以保留之外，其余的人都不能再保留，尤其是民间的私人藏书，应该由地方官员挨家挨户地清查，清查出